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十二指肠溃疡在X线钡剂检查时所显示的完影，是其间接影像，而在内窥镜下所见为其直视下的自然形态，且由于检查的痛苦少，易于反复检查，不存在X线的照射剂量问题，可以观察其动态变化及转归。
士二指肠溃疡呈粘膜浅表缺损，范围常较小，形态各一异，约3/4为圆形或椭圆形，其余呈线状、不规则形或三角形。少数的溃疡亦可大而深，伴有肿胀的边缘。约1/4患者的渡疡为多发性，边缘常不规则或皱缩，周围常有充血，色释由浅红、粉红至深红。溃疡旁炎症枯膜上常同时有糜烂，形态与溃疡相似，但较小而浅。溃疡有时可埋藏于肿胀的粘膜内而不易见到，溃疡表面常有一层黄白色薄苔搜盖。
溃疡愈合时，枯膜肿胀逐渐消退，边缘显露清楚，溃疡 “变为扁平，逐渐缩小，颜色由黄色变为灰白色，最后愈合， :溃疡消失遗下浅黄色旅痕，周围炎症则消退较慢。疙痕常为钱状，常称为线形瘫痕，有时呈不规则形或分枝状，可以很办。周围的枯膜往往向病变集中，呈放射状，可致成十二指扬球部变形、崎形，甚至形成假憩室。有时一个溃疡愈合，丽又有新的溃疡出现，或者邻近的糜烂融合成为新的溃疡.
大多数十二指肠溃疡易同时合并有十二指肠炎，往往溃疡已愈合，而十二指肠炎尚经久不退，有时枯膜肿胀，水肿明显，可见有出血点、出血斑。炎症可遍及十二指肠整个球腔，亦可呈片块状分布，片块之间的枯膜尚正常，亦可有枯膜粗糙不平。反复发作溃疡的结果可使幽门管变形，清晰的边缘消失，使十二指肠球部严重变形。
约有5%的十二指肠溃疡位于球后，常位于壶腹之上的十二指肠降部后壁和内侧壁，在壶腹之下者很少，这种球后溃疡常易发生出血。在怀疑有球后溃疡时，应进一步将纤维内窥镜向下送至十二指肠降部。有时由于局部狭窄和粘膜水肿、局部痉挛，而使内窥镜擂入困难，需注射抗胆碱能类药物来扩张十二指肠以便观察。在已肯定有十二指肠溃疡的患者，尚应注意检查胃部，如合并有胃溃疡即是复合溃疡。
